Det finns lite olika lösningar, men personligen tycker jag du ska byta ut Wine mot något annat. Jag kör VirtualBox och tycker det fungerar skitbra. Vmware är ju ett annat alternativ.
Hur som helst, ditt problem är att Wine inte förstår kopplingen mellan linux och windows, oavsett hur bra USB-stöd du har i Linux från första början. En lurig koppling är alltså vad du behöver =)
Till att börja med behöver du "gpsd" installerat så att din dator öht känner av gpsklockan.
Sedan en låtsaslänk mellan usbporten i linux och "com"-porten i ditt wine-windows.
sudo ln -s /dev/ttyUSB0 /dev/ttyS2 skulle kunna fungera.
ttyS2 motsvarar COM3, vilket du kan behöver komma ihåg när du ska komma åt klockan inne ifrån det program du använder i wine för att koppla upp dig mot klockan.
Det du kan komma ihåg är också att du inte behöver ställa i något program att det är USB du använder eftersom du "lurar" programmet att tro att klockan är ansluten till en COM-port.
Jag kan förstås inte lova att det fungerar men du kan ju testa i alla fall.
Ps. Om du har en massa saker kopplade till datorn får du byta port enligt regeln: COM1=/dev/ttyS0, COM2=/dev/ttyS1 osv... Ds.
